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	<title>Isabelita's Bio-blog &#187; Uncategorized</title>
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		<title>Isabelita's Bio-blog &#187; Uncategorized</title>
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		<title>Literalmente, ultima entrada del blog&#8230; gracias BioMINDS</title>
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		<pubDate>Thu, 30 Apr 2009 22:46:27 +0000</pubDate>
		<dc:creator>isabelitamz</dc:creator>
				<category><![CDATA[BioMinds]]></category>
		<category><![CDATA[Uncategorized]]></category>

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		<description><![CDATA[La experiencia de &#8220;Poster Day&#8221; fue una muy buena. Me correspondio evaluar a Rey Yamil Pagan, Jose Javier Diaz Torres y CHarles Fremaintt. Los tres tres casos se demostro que:

 el afiche conto con los componentes de abstracto, introduccion, metodologia y resultados.
El abstracto proveyo un resumen adecuado del trabajo.
La introduccion indico el conocimiento existente del [...]<img alt="" border="0" src="http://stats.wordpress.com/b.gif?host=isabelitamz.wordpress.com&blog=2825356&post=49&subd=isabelitamz&ref=&feed=1" />]]></description>
			<content:encoded><![CDATA[<div class='snap_preview'><br /><p>La experiencia de &#8220;Poster Day&#8221; fue una muy buena. Me correspondio evaluar a Rey Yamil Pagan, Jose Javier Diaz Torres y CHarles Fremaintt. Los tres tres casos se demostro que:</p>
<ol>
<li> el afiche conto con los componentes de abstracto, introduccion, metodologia y resultados.</li>
<li>El abstracto proveyo un resumen adecuado del trabajo.</li>
<li>La introduccion indico el conocimiento existente del tema y plantae el problema a investigar.</li>
<li>La metodologia establecio el procedimiento para evaluar la hipotesis.</li>
<li>Los resultados del proyescto se presentaron de forma clara.</li>
<li>La discusion de resultados confirmaron la hipotesis y en general el afiche estuvo en letra legible en tamano y formato.</li>
</ol>
<ul>
<li>Voy a comenzar describiendo el trabajo de Rey Yamil Pagan. El titulo de su proyecto es &#8220;Human Osteoblast Adhesion to Thermally Oxidezed Surfaces of 2 Types of Titanium Alloys&#8221;.   Rey demostro conocimiento del tema en todo tiempo y contesto con claridad haciendo referencia a los datos en su afiche. Su trabajo se trata de Biomateriales que son metales que se utilizan para implantes (como tornillos que se utilizan para unir huesos cuando estos se rompen).  Rey me explico, muy bien preparado, que la aleacion de Titanio, que en el momento se utiliza en estos implantes, a los 15 años del implante se liberan iones de Aluminio y Vanadio. Estos iones activan los osteoclastos (desgatan hueso) y los macrofagos, causando daño en el hueso. Su meta era encontrar un metal donde no sucediera esto.  Esto se logro al utilizar el metal alpha Titanio.</li>
</ul>
<ul>
<li>El segundo que evalue fue Jose Javier Diaz Torres. El titulo de su proyecto es &#8220;A proteomic analysis of pelletization in liquid cultures of <em>Phanerochaete chrysosporium</em>&#8220;.  Jose demostro conocimiento del tema en todo tiempo y contesto con claridad haciendo referencia a los datos en su afiche.   Jose utilizo tecnicas Microbiologicas y  Bioquimicas con el hongo filamentoso  <em>Phanerochaete chrysosporium. </em>La biomasa consta de 44% de celulosa, 26% de hemocelulosa y 30% de lignina.  La hemicelulosa es compleja y es dificil de degradar. La lignina que es en forma de matriz el hongo logra degradar los componentes de la misma.  La aplicacion que Jose quiere desarollar es en el cafe ya que se puede utilizar este hongo para degradar desperdicios del cafe y utilizarlo como composta o ver como degrada la cafeina de forma rapida y eficiente.</li>
</ul>
<ul>
<li>El ultimo al que visite y evalue fue Charles Fremaintt y el titulo de su investigacion es &#8220;Transcriptional Represion by Tup-1 Ssn6&#8243;.  Charles demostro conocimiento del tema en todo tiempo y contesto con claridad haciendo referencia a los datos en su afiche. El procedimiento que Charles utilizo fue uno bien aseptico para evitar invasores que fueran a dañar la tecnica ChIP. En el proceidimiendo experimental este cultivo levaura con formaldehido. Su meta era determinar la represion de Tup-1 Ssn6. Despues de terner el cultivo + plasmido con represor con marca para luego poderla cuantificar se utilizar el proceso CHIP el cual consta de precipitar la proteina, romperla con calor y luego amplificar utilizando PCR.  En conclusion mientras mas represor dentro del promotor de la celula el Tup-1 Ssn6 (co-represor) aumenta y si se disminuye represor, aumenta la actividad genetica para mRNA (la histona acetilada se separa). La importancia de este proyecto es que los humanos tienen un corepresor paracido al Tup-1 Ssn6 y entendiendo este se puede entender el corepresor de los humanos para desarrollo de tecnicas para combatir celulas cancerosas.</li>
</ul>
<p>Les deseo exito a cada uno de ustedes y a cada miembro de BioMINDS en su investigacion. Hay algunos que se graduan, otros continuan en su investigacion y otros pasan el batón a otro estudiante para que continue lo que con tanto esmero se logró hasta este momento. Fue un privilegio y un placer haber trabajado para BioMINDS y les quiero agradecer a ustedes y a la fundacion AMGEN por estos 3 semestres de ayuda, seguimiento, motivacion y esmero. Tambien quiero agradecerles a mis compañeros de laboratorio, mi mentor de maestria Roberto Román, gracias por tu paciencia, dedicacion y empeño en lo que haces&#8230; Exito en tu carrera!!; a Alitza Santiago mi compañera subgraduada y a la doctora Sandra Maldonado por su mentoria, amor, direccion, dedicacion e ideas&#8230;eres tremendo ser humano.  Bendiciones a todos!!</p>
<p>*** SI HAY ALGUNA INFORMACION CONFIDENCIAL ACERCA DE SU INVESTIGACION Y REY, JOSE o CHARLES NECESITAN QUE LA ELIMINE DE ESTE FORO POR FAVOR NO DUDEN EN COMUNICARSE CONMIGO.</p>
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		<title></title>
		<link>http://isabelitamz.wordpress.com/2009/03/02/46/</link>
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		<pubDate>Mon, 02 Mar 2009 16:02:04 +0000</pubDate>
		<dc:creator>isabelitamz</dc:creator>
				<category><![CDATA[Uncategorized]]></category>

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		<description><![CDATA[ progreso 
   3 – progreso intermedio.

He logrado al menos 50% de los objetivos propuestos ya que se han logrado procesar muestras de otras dos localidades y se han logrado recuperar mas levaduras. Tambien se han identificado varias levaduras. 
Se identifico Hortaea werneckii de la entrada de la planta de tratamiento de agua de Adjuntas. Esta levadura es negra y [...]<img alt="" border="0" src="http://stats.wordpress.com/b.gif?host=isabelitamz.wordpress.com&blog=2825356&post=46&subd=isabelitamz&ref=&feed=1" />]]></description>
			<content:encoded><![CDATA[<div class='snap_preview'><br /><p> progreso <br />
   3 – progreso intermedio.</p>
<ol>
<li>He logrado al menos 50% de los objetivos propuestos ya que se han logrado procesar muestras de otras dos localidades y se han logrado recuperar mas levaduras. Tambien se han identificado varias levaduras. </li>
<li>Se identifico <em>Hortaea werneckii</em> de la entrada de la planta de tratamiento de agua de Adjuntas. Esta levadura es negra y esta cubierta con una capa fina de micelio.</li>
<li>Tambien se encontraron 6 aislados con capsulas despues de haberles hecho pruebas con tinta china, estas pertencen a la entrada y salida de plantas de tratamiento de agua en Adjuntas y Mayaguez.  Estos aislados podrian ser <em>Cryptococcus neoformans,</em> una levadura patogenica que se conoce que causa meningitis</li>
<li>Una difucultad que se enfrente es que el protocolo que se estaba haciendo para extraer el DNA de las levaduras y asi poder identificarlas no estaba dando resultado, pero hace dos dias el Dr. Carlos Rodriguez profesor de Microbiologia del RUM nos ofrecio un taller con un protocolo distinto y pudimos extraer DNA!!!</li>
</ol>
<p><span style="font-size:12pt;font-family:&quot;"><span style="color:black;"><span style="font-size:12pt;font-family:&quot;"><span style="color:black;"><span style="font-size:10pt;color:black;font-family:&quot;"> </span></span></span></span></span>**** La actualizacion del Abstract esta descrito en los &#8220;bullets&#8221;</p>
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		<item>
		<title>Metas para el 3er semestre de investigacion</title>
		<link>http://isabelitamz.wordpress.com/2009/01/29/metas-para-el-3er-semestre-de-investigacion/</link>
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		<pubDate>Thu, 29 Jan 2009 17:49:41 +0000</pubDate>
		<dc:creator>isabelitamz</dc:creator>
				<category><![CDATA[Uncategorized]]></category>

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		<description><![CDATA[
Ya hay levaduras aisladas de 3 lugares (Planta de tratamiento de agua de Mayaguez y Arecibo y Bosque Susua en Sabana Grande)
Aun falta por procesar mas muestras, de locali dades como : Cabo Rojo, Parguera, Aguada y  Barceloneta- entre otros. Asi que este semestre estaremos haciendo eso.
Ademas se estara haciendo extracción de DNA y algunas [...]<img alt="" border="0" src="http://stats.wordpress.com/b.gif?host=isabelitamz.wordpress.com&blog=2825356&post=40&subd=isabelitamz&ref=&feed=1" />]]></description>
			<content:encoded><![CDATA[<div class='snap_preview'><br /><ul>
<li>Ya hay levaduras aisladas de 3 lugares (Planta de tratamiento de agua de Mayaguez y Arecibo y Bosque Susua en Sabana Grande)</li>
<li>Aun falta por procesar mas muestras, de locali dades como : Cabo Rojo, Parguera, Aguada y  Barceloneta- entre otros. Asi que este semestre estaremos haciendo eso.</li>
<li>Ademas se estara haciendo extracción de DNA y algunas otras pruebas de identificacion de levaduras tales como: prueba con &#8216;india ink&#8217; para identificar Cryptococcus neoformans y Pruebas en &#8216;Corn Meal Agar&#8217; para identificar clamidosporas de Candida albicans.</li>
<li>Se haran las pruebas con el antifúngico Fluconazol para determinar el MIC (minimal inhibition concentration) de cada levadura con respecto al antifúngico.</li>
</ul>
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	</item>
		<item>
		<title>Progreso&#8230;</title>
		<link>http://isabelitamz.wordpress.com/2008/09/26/progreso/</link>
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		<pubDate>Fri, 26 Sep 2008 14:36:54 +0000</pubDate>
		<dc:creator>isabelitamz</dc:creator>
				<category><![CDATA[BioMinds]]></category>
		<category><![CDATA[Uncategorized]]></category>
		<category><![CDATA[antibioticos]]></category>
		<category><![CDATA[bio minds]]></category>
		<category><![CDATA[bioblog]]></category>
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		<category><![CDATA[levaduras]]></category>
		<category><![CDATA[levaduras resitentes a antibioticos]]></category>

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		<description><![CDATA[Las tecincas que mas utilizo en el laboratio son: dilucion en serie y filtrado. Un procedimiento nuevo que estaremos llevando a cabo sera el metodo estandar de dilucion para pruebas de suceptibilidad de las levaduras a agentes antigungicos. Este procedimiento esta diseñado para probarse con levaduras resitentes a antifungicos que causan infecciones al ser humano. Estoy [...]<img alt="" border="0" src="http://stats.wordpress.com/b.gif?host=isabelitamz.wordpress.com&blog=2825356&post=24&subd=isabelitamz&ref=&feed=1" />]]></description>
			<content:encoded><![CDATA[<div class='snap_preview'><br /><p><a href="http://isabelitamz.files.wordpress.com/2008/09/p1010063.jpg"><img class="alignright size-thumbnail wp-image-25" title="Mis hermosas levaduras" src="http://isabelitamz.files.wordpress.com/2008/09/p1010063.jpg?w=157&#038;h=112" alt="" width="157" height="112" /></a>Las tecincas que mas utilizo en el laboratio son: dilucion en serie y filtrado. Un procedimiento nuevo que estaremos llevando a cabo sera el metodo estandar de dilucion para pruebas de suceptibilidad de las levaduras a agentes antigungicos. Este procedimiento esta diseñado para probarse con levaduras resitentes a antifungicos que causan infecciones al ser humano. Estoy muy contenta de ya tener este procedimiento en mis manos. Aun estamos aislando levaduras, pero pronto podre hacer estas pruebas.</p>
<p>Una de las difucultades que tan reciente como ayer nos dimos cuenta que esta ocurriendo es que al aislar las &#8220;levaduras&#8221; nos dimos cuenta que hay bacterias (bacilos y cocos) que a simple vista se parecen a las levaduras y estan creciendo en nuestros platos por esto puedo decir que he logrado un progreso intermedio (3) ya que tambien las muestras se demoraron en llegar y aunque llevamos el trabajo bastante avanzado estuvimos como dos semanas en espera de las ansiadas muestras. Ahora nos queda averiguar que factores ayudaran a que crezcan levaduras y no bacterias ( temperatura, cantidad de cloranfenicol en el medio, etc).</p>
<p>Le quiero agradecer al estudiante graduado Roberto Román ya que estamos trabajando juntos en esta travesia y a la Dra. Sandra maldonado por su mentoría, apoyo e ideas.</p>
  <a rel="nofollow" href="http://feeds.wordpress.com/1.0/gocomments/isabelitamz.wordpress.com/24/"><img alt="" border="0" src="http://feeds.wordpress.com/1.0/comments/isabelitamz.wordpress.com/24/" /></a> <a rel="nofollow" href="http://feeds.wordpress.com/1.0/godelicious/isabelitamz.wordpress.com/24/"><img alt="" border="0" src="http://feeds.wordpress.com/1.0/delicious/isabelitamz.wordpress.com/24/" /></a> <a rel="nofollow" href="http://feeds.wordpress.com/1.0/gostumble/isabelitamz.wordpress.com/24/"><img alt="" border="0" src="http://feeds.wordpress.com/1.0/stumble/isabelitamz.wordpress.com/24/" /></a> <a rel="nofollow" href="http://feeds.wordpress.com/1.0/godigg/isabelitamz.wordpress.com/24/"><img alt="" border="0" src="http://feeds.wordpress.com/1.0/digg/isabelitamz.wordpress.com/24/" /></a> <a rel="nofollow" href="http://feeds.wordpress.com/1.0/goreddit/isabelitamz.wordpress.com/24/"><img alt="" border="0" src="http://feeds.wordpress.com/1.0/reddit/isabelitamz.wordpress.com/24/" /></a> <img alt="" border="0" src="http://stats.wordpress.com/b.gif?host=isabelitamz.wordpress.com&blog=2825356&post=24&subd=isabelitamz&ref=&feed=1" /></div>]]></content:encoded>
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		<media:content url="http://isabelitamz.files.wordpress.com/2008/09/p1010063.jpg?w=128" medium="image">
			<media:title type="html">Mis hermosas levaduras</media:title>
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	</item>
		<item>
		<title>Ya se fue el verano!!</title>
		<link>http://isabelitamz.wordpress.com/2008/08/27/ya-se-fue-el-verano/</link>
		<comments>http://isabelitamz.wordpress.com/2008/08/27/ya-se-fue-el-verano/#comments</comments>
		<pubDate>Wed, 27 Aug 2008 14:50:46 +0000</pubDate>
		<dc:creator>isabelitamz</dc:creator>
				<category><![CDATA[BioMinds]]></category>
		<category><![CDATA[Uncategorized]]></category>
		<category><![CDATA[antibiticos]]></category>
		<category><![CDATA[levaduras]]></category>
		<category><![CDATA[levaduras resistentes a antibioticos]]></category>
		<category><![CDATA[RUM]]></category>

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		<description><![CDATA[ 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Este verano fue interesante!! En realidad no hice una investigacion como tal pero estuve en Haiti en una Mision donde un grupo de cirujanos va a dar de su servicio a la gente necesitada. Creanme! fue como hacer una investigacion!! Fue una experiencia increible ya que quiero seuir mis estudios graduados en medicina y estuve [...]<img alt="" border="0" src="http://stats.wordpress.com/b.gif?host=isabelitamz.wordpress.com&blog=2825356&post=15&subd=isabelitamz&ref=&feed=1" />]]></description>
			<content:encoded><![CDATA[<div class='snap_preview'><br /><div id="attachment_20" class="wp-caption alignleft" style="width: 303px"><a href="http://isabelitamz.files.wordpress.com/2008/09/n517608449_800528_1447.jpg"><img class="size-full wp-image-20" title="n517608449_800528_1447" src="http://isabelitamz.files.wordpress.com/2008/09/n517608449_800528_1447.jpg?w=293&#038;h=288" alt="Aqui en Haiti ayudando al Dr. Jean Riviere" width="293" height="288" /></a><p class="wp-caption-text">Aqui en Haiti ayudando al Dr. Jean Riviere</p></div>
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<p>Este verano fue interesante!! En realidad no hice una investigacion como tal pero estuve en Haiti en una Mision donde un grupo de cirujanos va a dar de su servicio a la gente necesitada. Creanme! fue como hacer una investigacion!! Fue una experiencia increible ya que quiero seuir mis estudios graduados en medicina y estuve en todo tiempo en la sala de operaciones ayudando en lo que se podia. Aprendi muchisimo!!! Las cirugias mas comunes fueron hernias, quistes y circunciciones.</p>
<p>Para este proximo semestre espero &#8230;</p>
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<li>poder identificar con presicion (nombre y apellido jaja) mis hermosas levaduras de ecosistemas marinos que son resistentes a antibiticos</li>
<li>poder hacer un trabajo mas rapido y eficiente ya que el semestre pasado tuve una buena practica&#8230; asi que este semestre ya puedo hacer procedimientos con mucha mas agilidad.</li>
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<p>Este semestre va a ser mas intenso e interesante. Todo se hara mas consciente y cuidadosamente. Los resultados que obtengamos seran definitivos y cruciales en nuestra investigacion. Estamos tomando las mejores medidas para que todo quede bien. Discutimos el procedimiento experimental y de donde obtendremos las muestras. Definitivamente este semestre iremos mas rapido que el semestre pasado.</p>
<p>Como nuevo metodo de identificacion de levaduras utilizaremos el medoto de API. El sistema está estandarizado, y combina 8 pruebas convencionales y 12 de asimilación. El kit consta de una galeria con 20 microtubos conteniéndo medios y/o sustratos en forma deshidratada. Los test convencionales, se inoculan con una suspensión de la cepa a analizar en solución salina. Tras un periodo de incubación de 24-48 horas a 30 ºC se pueden observar virajes de color en el medio, bien directamente o tras adición de reactivos. Los test de asimilación se inoculan con un medio mínimo, observándose crecimiento bacteriano si la cepa a analizar es susceptible de utilizar el sustrato correspondiente. La lectura del API se realiza sumando las pruebas positivas por tríos. Se obtiene un número clave para la bacteria en cuestión, que puede ser buscado en una tabla de códigos.  (<a href="http://www.galeon.com/lactobacilo/micro.htm">http://www.galeon.com/lactobacilo/micro.htm</a>)</p>
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